Η Roche ιδρύθηκε το 1896 από τον Fritz Hoffmann-La Roche. Η εταιρεία ήταν από νωρίς γνωστή για την παραγωγή διαφόρων παρασκευασμάτων βιταμινών και παραγώγων. Το 1934 έγινε η πρώτη εταιρεία που παρήγαγε μαζικά συνθετική βιταμίνη C, με την επωνυμία Redoxon. Κατά τη διάρκεια του Δευτέρου Παγκοσμίου Πολέμου, η Roche συνεργάστηκε με το ναζιστικό καθεστώς στη Γερμανία και χρησιμοποίησε καταναγκαστική εργασία στα εργοστάσιά της με έδρα τη Γερμανία και την Πολωνία.Επίσης, μετέφεραν όλους τους Εβραίους υπαλλήλους τους στις Ηνωμένες Πολιτείες για να τους σώσουν από την προσοχή των Ναζί.
Το 1957, η Hoffmann-La Roche εισήγαγε την κατηγορία των ηρεμιστικών γνωστών ως βενζοδιαζεπίνες (με το Valium και το Rohypnol να είναι τα πιο γνωστά μέλη). Κατασκευάζει και πουλά αρκετά αντικαρκινικά φάρμακα και κατέχει ηγετική θέση στον τομέα αυτό. Το 1956, το πρώτο αντικαταθλιπτικό, η ιπρονιαζίδη, δημιουργήθηκε κατά λάθος κατά τη διάρκεια ενός πειράματος κατά τη σύνθεση της ισονιαζίδης. Αρχικά, είχε σκοπό να δημιουργήσει ένα πιο αποτελεσματικό φάρμακο για την καταπολέμηση της φυματίωσης. Ωστόσο, η ιπρονιαζίδη αποκαλύφθηκε ότι έχει τα δικά της οφέλη. μερικοί άνθρωποι ένιωσαν ότι τους έκανε να νιώθουν πιο ευτυχισμένοι. Αποσύρθηκε από την αγορά στις αρχές της δεκαετίας του 1960 λόγω τοξικών παρενεργειών.
Το 1976, ένα ατύχημα σε ένα χημικό εργοστάσιο στο Seveso της Ιταλίας, που ανήκει σε θυγατρική της Roche, προκάλεσε μεγάλη μόλυνση από διοξίνες. Το 1982, ο βραχίονας της εταιρείας στις Ηνωμένες Πολιτείες εξαγόρασε την Biomedical Reference Laboratories για 163,5 εκατομμύρια δολάρια ΗΠΑ. Αυτή η εταιρεία χρονολογείται από τα τέλη της δεκαετίας του 1960 και βρισκόταν στο Μπέρλινγκτον της Βόρειας Καρολίνας. Εκείνο το έτος η Hoffmann-La Roche τη συγχώνευσε με όλα τα εργαστήριά της και ενσωμάτωσε τη συγχωνευμένη εταιρεία ως Roche Biomedical Laboratories, Inc. στο Μπέρλινγκτον. Στις αρχές της δεκαετίας του 1990, η Roche Biomedical έγινε ένα από τα μεγαλύτερα δίκτυα κλινικών εργαστηρίων στις Ηνωμένες Πολιτείες, με 20 μεγάλα εργαστήρια και πωλήσεις 600 εκατομμυρίων δολαρίων ΗΠΑ.
Η Roche έχει επίσης δημιουργήσει διάφορα τεστ HIV και αντιρετροϊκά φάρμακα. Αγόρασε τα διπλώματα ευρεσιτεχνίας για την τεχνική της αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR) το 1992. Το 1995, η εποχή της υψηλής ενεργητικής αντιρετροϊκής θεραπείας (HAART) ξεκίνησε με την έγκριση από τον FDA των Ηνωμένων Πολιτειών για τον αναστολέα πρωτεάσης HIV του Hoffman LaRoche, τη σακουιναβίρη. Μέσα σε 2 χρόνια από την έγκρισή του (και του ritonavir 4 μήνες αργότερα) οι ετήσιοι θάνατοι από AIDS στις Ηνωμένες Πολιτείες μειώθηκαν από πάνω από 50.000 σε περίπου 18.000. Στις 28 Απριλίου 1995, η Hoffmann-La Roche πούλησε τη Roche Biomedical Laboratories, Inc. στην National Health Laboratories Holdings Inc. (η οποία στη συνέχεια άλλαξε το όνομά της σε Laboratory Corporation of America Holdings). Η Roche εξαγόρασε τη Syntex το 1994 και την Chugai Pharmaceuticals το 2002.
Οσελταμιβίρη ένα αντιικό φάρμακο που χρησιμοποιείται για την καταπολέμηση της γρίπης. Η Roche είναι η μόνη φαρμακευτική εταιρεία που είναι εξουσιοδοτημένη να παρασκευάζει το φάρμακο, το οποίο ανακαλύφθηκε από την Gilead Sciences. Η Roche αγόρασε τα δικαιώματα του φαρμάκου το 1996 και το 2005 διευθέτησε μια διαφορά σχετικά με τα δικαιώματα, συμφωνώντας να πληρώσει κλιμακωτά δικαιώματα της Gilead ύψους 14–22% των ετήσιων καθαρών πωλήσεων χωρίς να προσαρμόσει τις πληρωμές για το κόστος παραγωγής, όπως επιτρεπόταν στην αρχική άδεια συμφωνία.
